Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNT3P45378 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNT3P45378 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms