Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTSOP43234 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSOP43234 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSOP43234 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSOP43234 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSOP43234 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTSOP43234 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTSOP43234 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTSOP43234 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTSOP43234 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTSOP43234 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTSOP43234 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTSOP43234 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTSOP43234 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms