Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDF5P43026 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GDF5P43026 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDF5P43026 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GDF5P43026 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GDF5P43026 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF5P43026 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms