Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA2P42262 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA2P42262 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms