Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFSF9P41273 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFSF9P41273 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFSF9P41273 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms