Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARL1P40616 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARL1P40616 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARL1P40616 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARL1P40616 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
ARL1P40616 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARL1P40616 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms