Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VHLP40337 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VHLP40337 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VHLP40337 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VHLP40337 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VHLP40337 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VHLP40337 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
VHLP40337 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
VHLP40337 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
VHLP40337 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VHLP40337 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VHLP40337 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
VHLP40337 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
VHLP40337 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VHLP40337 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VHLP40337 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
VHLP40337 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VHLP40337 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VHLP40337 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms