Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MYCNOSP40205 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MYCNOSP40205 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms