Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPL4P36578 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL4P36578 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL4P36578 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL4P36578 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPL4P36578 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL4P36578 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPL4P36578 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL4P36578 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms