Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYH11P35749 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYH11P35749 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYH11P35749 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYH11P35749 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYH11P35749 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYH11P35749 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYH11P35749 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYH11P35749 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH11P35749 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH11P35749 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH11P35749 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH11P35749 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH11P35749 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH11P35749 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH11P35749 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH11P35749 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH11P35749 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH11P35749 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH11P35749 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms