Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SFTPDP35247 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SFTPDP35247 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms