Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-FP30511 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HLA-FP30511 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms