Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIPP30301 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIPP30301 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIPP30301 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MIPP30301 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIPP30301 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIPP30301 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIPP30301 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIPP30301 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIPP30301 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIPP30301 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIPP30301 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIPP30301 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms