Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CD40LGP29965 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD40LGP29965 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms