Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EPHB2P29323 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHB2P29323 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms