Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCD3P28288 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD3P28288 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.9 ms