Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB9P28065 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB9P28065 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms