Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFP26441 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFP26441 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTFP26441 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTFP26441 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTFP26441 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTFP26441 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTFP26441 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTFP26441 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTFP26441 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTFP26441 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFP26441 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFP26441 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTFP26441 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNTFP26441 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTFP26441 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms