Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.7	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YHL012W	YHL012W	1482 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	TGL1	YKL140W	1647 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	SRS2	YJL092W	3525 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	ARX1	YDR101C	1782 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	PIC2	YER053C	903 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	FMP46	YKR049C	402 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	RRP40	YOL142W	723 nt		4.69	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	JHD2	YJR119C	2187 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	LYS2	YBR115C	4179 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	IME4	YGL192W	1803 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	BUD30	YDL151C	582 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	ARD1	YHR013C	717 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YNR061C	YNR061C	660 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	GIP4	YAL031C	2283 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	IOC4	YMR044W	1428 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	PUF2	YPR042C	3228 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	PRP31	YGR091W	1485 nt		4.68	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	OLE1	YGL055W	1533 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	MDM34	YGL219C	1380 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	ENT5	YDR153C	1236 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	RPB7	YDR404C	516 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	MRP13	YGR084C	1020 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	CDC42	YLR229C	576 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YNL181W	YNL181W	1224 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	CUS1	YMR240C	1311 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YCR023C	YCR023C	1836 nt		4.67	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	PEP5	YMR231W	3090 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	RIM21	YNL294C	1602 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	OCA4	YCR095C	1089 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YFT2	YDR319C	825 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YFR045W	YFR045W	930 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YAR030C	YAR030C	342 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	EMG1	YLR186W	759 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	RNA1	YMR235C	1224 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	BUD8	YLR353W	1812 nt		4.66	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	PUS9	YDL036C	1389 nt		4.65	□□□□□ -1.66
RPC53	P25441	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YAE1	YJR067C	426 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	VPS68	YOL129W	555 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	BCH2	YKR027W	2298 nt		4.65	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YPL260W	YPL260W	1656 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RPG1	YBR079C	2895 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	PHO87	YCR037C	2772 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	PHO13	YDL236W	939 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RAD27	YKL113C	1149 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	VPS28	YPL065W	729 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SPN1	YPR133C	1233 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	POP4	YBR257W	840 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	HOM3	YER052C	1584 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	TAF12	YDR145W	1620 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	THS1	YIL078W	2205 nt		4.64	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	HO	YDL227C	1761 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	FLO8	YER109C	2400 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SPO1	YNL012W	1896 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YIL171W	YIL171W	330 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	JLP1	YLL057C	1239 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YLR462W	YLR462W	609 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RSM23	YGL129C	1353 nt		4.63	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SAT4	YCR008W	1812 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	ALR2	YFL050C	2577 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	PEX30	YLR324W	1572 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YPK3	YBR028C	1578 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	PTR3	YFR029W	2037 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YGL199C	YGL199C	471 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RPS4B	YHR203C	786 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	RPS4A	YJR145C	786 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YML119W	YML119W	1074 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YPL025C	YPL025C	558 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YDC1	YPL087W	954 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	CTR1	YPR124W	1221 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	NAM2	YLR382C	2685 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.62	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	YMR1	YJR110W	2067 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SPC3	YLR066W	555 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	IMP2	YMR035W	534 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	SPC24	YMR117C	642 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	snR37	snR37	386 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	IDS2	YJL146W	1410 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	PRP19	YLL036C	1512 nt		4.61	□□□□□ -1.67
RPC53	P25441	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.6	□□□□□ -1.67

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