Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFSF4P23510 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFSF4P23510 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms