Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRBP23467 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRBP23467 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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