Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFX1P22670 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFX1P22670 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX1P22670 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX1P22670 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFX1P22670 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFX1P22670 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFX1P22670 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFX1P22670 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFX1P22670 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX1P22670 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFX1P22670 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms