Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNA4P22459 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA4P22459 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms