Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGFR4P22455 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGFR4P22455 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms