Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFAIP3P21580 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFAIP3P21580 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms