Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCP20941 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCP20941 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCP20941 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCP20941 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCP20941 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCP20941 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCP20941 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDCP20941 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCP20941 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCP20941 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCP20941 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCP20941 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDCP20941 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDCP20941 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDCP20941 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms