Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXA5P20719 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXA5P20719 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms