Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
AMY2BP19961 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMY2BP19961 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms