Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM21P19474 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM21P19474 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms