Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF4P18085 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF4P18085 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF4P18085 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF4P18085 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF4P18085 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF4P18085 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF4P18085 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF4P18085 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF4P18085 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARF4P18085 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARF4P18085 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms