Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERCC2P18074 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms