Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTPS1P17812 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTPS1P17812 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTPS1P17812 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms