Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOT1P17174 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GOT1P17174 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GOT1P17174 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GOT1P17174 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GOT1P17174 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GOT1P17174 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOT1P17174 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOT1P17174 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GOT1P17174 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GOT1P17174 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GOT1P17174 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GOT1P17174 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOT1P17174 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GOT1P17174 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GOT1P17174 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms