Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GNB3P16520 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB3P16520 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB3P16520 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB3P16520 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GNB3P16520 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GNB3P16520 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GNB3P16520 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GNB3P16520 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GNB3P16520 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GNB3P16520 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GNB3P16520 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GNB3P16520 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms