Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA1P15976 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GATA1P15976 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GATA1P15976 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATA1P15976 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATA1P15976 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GATA1P15976 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GATA1P15976 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GATA1P15976 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GATA1P15976 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms