Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSPT1P15170 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSPT1P15170 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSPT1P15170 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms