Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RLBP1P12271 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RLBP1P12271 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms