Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT3P12035 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT3P12035 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT3P12035 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT3P12035 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT3P12035 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT3P12035 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms