Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFP11831 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRFP11831 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRFP11831 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRFP11831 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRFP11831 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRFP11831 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRFP11831 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRFP11831 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRFP11831 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRFP11831 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms