Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
MYH3P11055 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYH3P11055 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYH3P11055 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH3P11055 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MYH3P11055 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH3P11055 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH3P11055 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYH3P11055 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYH3P11055 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MYH3P11055 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MYH3P11055 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH3P11055 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH3P11055 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
MYH3P11055 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYH3P11055 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.51■■■□□ 2
MYH3P11055 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYH3P11055 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYH3P11055 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH3P11055 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH3P11055 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH3P11055 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH3P11055 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYH3P11055 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MYH3P11055 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYH3P11055 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH3P11055 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH3P11055 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYH3P11055 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms