Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3P10147 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL3P10147 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL3P10147 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL3P10147 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL3P10147 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL3P10147 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL3P10147 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL3P10147 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL3P10147 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms