Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GLI4P10075 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GLI4P10075 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GLI4P10075 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GLI4P10075 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GLI4P10075 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GLI4P10075 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GLI4P10075 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GLI4P10075 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GLI4P10075 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GLI4P10075 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GLI4P10075 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GLI4P10075 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms