Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GLI3P10071 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GLI3P10071 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GLI3P10071 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GLI3P10071 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GLI3P10071 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GLI3P10071 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GLI3P10071 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GLI3P10071 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GLI3P10071 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GLI3P10071 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GLI3P10071 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GLI3P10071 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GLI3P10071 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GLI3P10071 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GLI3P10071 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GLI3P10071 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI3P10071 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI3P10071 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI3P10071 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GLI3P10071 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI3P10071 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI3P10071 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GLI3P10071 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GLI3P10071 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GLI3P10071 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI3P10071 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI3P10071 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI3P10071 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI3P10071 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GLI3P10071 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GLI3P10071 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GLI3P10071 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms