Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGB3P0DN86 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms