Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP9P0CG40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SP9P0CG40 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SP9P0CG40 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP9P0CG40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SP9P0CG40 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms