Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2MP0CAP2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2MP0CAP2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2MP0CAP2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms