Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB7P09629 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXB7P09629 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms