Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLTAP09496 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLTAP09496 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLTAP09496 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTAP09496 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTAP09496 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTAP09496 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLTAP09496 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLTAP09496 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLTAP09496 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLTAP09496 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms