Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOEP02649 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOEP02649 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOEP02649 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
APOEP02649 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOEP02649 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOEP02649 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOEP02649 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOEP02649 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms