Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SPTA1P02549 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPTA1P02549 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms